En 2007, 133 pêcheurs professionnels (10% de moins qu'en 2006) et 8022 pêcheurs amateurs (soit 10% de plus qu'en 2006) ont pratiqué la pêche sur le Léman. Le poids total des truites, corégones, ombles, perches et brochets pêché s’est élevé à 546 tonnes, soit 95 tonnes de moins qu'en 2006. Avec 495 tonnes, les pêcheurs professionnels réalisent environ 90% des captures. Le corégone, qui bénéficie visiblement de l'amélioration de la qualité des eaux du Léman, reste l’espèce la plus prélevée du lac avec 267 tonnes. Le recul des captures de près de 92 tonnes par rapport à 2006 s'explique surtout par les problèmes des algues. La perche occupe la deuxième place avec 220 tonnes, les prises restant relativement stables depuis 2004.
Prolifération des brochets: Les prises de brochets totalisent 39 tonnes, soit 4 tonnes de plus qu’en 2006, mais 8 tonnes de moins qu'en 2005. Cette espèce prolifère depuis une dizaine d'années, alors qu'il s'en péchait souvent moins de 5 tonnes par an dans les années 80 et 90. Cette prolifération représente un risque pour d'autres espèces (prédation des espèces menacées truites et ombles, transmission de parasite aux perches). De ce fait, la Commission autorise depuis plusieurs années des pêches supplémentaires durant l'hiver, une mesure qui sera reconduite pour l'hiver 2008/2009.
Depuis deux ans, la Commission a également autorisé la pêche du brochet durant la période de reproduction, au printemps. Le groupe de travail « Plan d’aménagement piscicole » décidera en février prochain de la reconduction de cette mesure en 2009, sur la base d'une analyse détaillée des résultats de la pêche 2008.
L’omble chevalier en déclin: L’omble chevalier poursuit son recul avec seulement 10,5 tonnes de captures, soit 3 tonnes de moins que l’année précédente et la valeur la plus basse enregistrée depuis plus de 20 ans. Cette situation préoccupe la commission, mais la recherche sur les causes de ce déclin progresse lentement. Tous les jeunes ombles remis à l'eau en 2007 ont été marqués, mais ce n'est qu'en 2009 que cette génération de poissons pourra faire l’objet de toute l’attention des chercheurs. En 2008, le suivi des contenus stomacaux des brochets capturés dans les zones d’immersion des jeunes ombles n’a pas permis de confirmer l’hypothèse de la prédation par le brochet. L’interdiction de plonger sur les omblières sera maintenue dans les deux pays, après qu'une négociation avec les plongeurs vaudois a permis de trouver une solution satisfaisante pour le site de Chillon.
Peu de truites: La quantité de truites lacustres pêchées représente moins de 10 tonnes, une valeur qui reste très basse. La Commission attache une attention particulière à cette espèce. Afin de vérifier l'efficacité des mesures de repeuplement, la totalité des rempoissonnements de truitelles 2008 sur le bassin lémanique ont été marquées, comme les ombles en 2007. Les scientifiques ont été mandatés pour assurer le suivi de cette opération les prochaines années. Par ailleurs, la Commission encourage toujours les actions menées sur les rivières pour faciliter la reproduction naturelle des truites lacustres, en rendant franchissables les obstacles et en améliorant la qualité de l'eau et des milieux. A ce sujet, elle a pris acte avec satisfaction des importants travaux réalisés en 2008 par le canton de Genève pour renaturer le barrage des Usiniers sur la Versoix.